主要成份不一样。
纳豆粉主要成份为纳豆菌、纳豆多肽、纳豆多糖、黏液素、超氧化物歧化酶（SOD）、谷胱甘肽、纳豆激酶、吡啶二羧酸、溶菌酶、高弹性蛋白酶、卵磷脂、皂甙、异黄酮、维生素K2、维生素E、B族维生素、多种矿物质等，有150种以上的生理活性物质。
酵母粉的主要成分为酵母、山梨醇酐单硬脂酸酯、维生素C等，酵母粉酵母是一种微生物，是一种天然发酵剂（非化学）。属于生物发酵。
纳豆粉是由纳豆研磨制成的，富含异黄酮和不饱和脂肪酸，能够促进人体的新陈代谢，加入人体肠胃蠕动，从而达到缓解便秘的症状，适量食用能够调节人体血糖以及在一定程度上溶解血栓，有助于预防心血管疾病。
酵母粉是酵母没有经过分解，但酵母浸粉的营养物质得到过分解，微生物吸收利用的速度和效率更高，发酵残留少；生物发酵研究基本上采取酵母浸粉、酵母浸膏为多，酵母粉主要在传统的抗生素等发酵行业应用较广泛。
