他们最大的区别就是房产权的不同，公寓的房产权是在70年，小产权房是在40年，所以大家搞清楚，但是公寓更适合居住，小产权房一般是独立出去的，他的位置比较安静，产权公寓一般都是好几户在一起，里面的环也有些差些，但是居住的面积都很小，小产权房大一点
1、概念不同：
公寓房是商业地产投资中最为广泛的一种地产形式。公寓房最早是舶来品，相对于独院独户的别墅，更为经济实用。小产权房是指在农民集体土地上建设的房屋，未缴纳土地出让金等费用，其产权证不是由国家房管部门颁发，而是由乡政府或村政府颁发。
2、交易条件不同：
小产权房虽然便宜，但是因为不被国家承认，所以不能上市交易。而公寓房是可以上市交易的。
3、五证区别：
小产权房是缺乏国有土地使用证的，而公寓房是五证齐全的。
4、拆迁区别：
小产权房实际上是属于在政府规定范围以外的违章建筑，如果和国家的规划相冲突，就极有可能被拆除，但是因为其不受法律保护，因此也不会得到拆迁安置补偿。公寓房被拆迁是会有一定赔偿的，对被征收房屋价值的补偿，不得低于房屋征收决定公告之日被征收房屋类似房地产的市场价格。被征收房屋的价值，由具有相应资质的房地产价格评估机构按照房屋征收评估办法评估确定。
